सेंसर बोर्ड ने फिल्म 'बजरंगी भाईजान' को 5 कट के साथ पास कर दिया है. जहां फिल्म में आपत्तिजनक शब्द थे और भगवान राम का जिक्र था, वहां कट मारकर फिल्म को यू/ए सर्टिफिकेट दे दिया गया है. गृह मंत्रालय के एक कम्युनिकेशन के चलते बोर्ड को भी इस बात का डर था कि फिल्म के कंटेंट से कोई जातीय या धार्मिक तनाव जैसा माहोल पैदा न हो जाए. इसलिए फिल्म को सर्टिफिकेट देते समय सेंट्रल बोर्ड ऑफ फिल्म सर्टिफिकेशन (सीबीएफसी) ने एक्जामिनिंग कमेटी में 2 मुस्लिम सदस्यों को भी शामिल कर लिया और फिर फिल्म को यू/ए सर्टिफिकेट दे दिया.

सरकारी सूत्रों के अनुसार गृह मंत्रालय को इस बात का डर था कि फिल्म की कई बातों पर कुछ लोग आपत्ति उठाकर उनके आधार पर जातीय तनाव भी पैदा कर सकते हैं. इस सबसे जातीय दंगों की स्थिति भी उत्पन्न हो सकती है. इसीलिए गृह मंत्रालय ने सीबीएफसी को पहले से आगाह कर दिया था कि फिल्म को बहुत बारीकी से जांचा और परखा जाए. आपको बतादे की कबीर खान द्वारा निर्देशित फिल्म में सलमान खान के साथ करीना कपूर खान और नवाजुद्दीन सिद्दीकी भी मुख्य भूमिका में है.